Johannes Trojan war ein deutscher Schriftsteller.
Johannes Trojan wurde in Danzig als Sohn eines Kaufmanns geboren, der eine Zeit lang Vorsteher der Stadtverordneten und seit 1849 Deputierter der zweiten Kammer in Berlin war. In seiner Freizeit dichtete der Vater oft, was sich auf seinen Sohn übertrug. 1841 starb die Mutter, der Vater verheiratete sich bald wieder. Johannes Trojan besuchte das Gymnasium Danzig, an dem er 1856 seine Reifeprüfung ablegte.
Zunächst studierte er fünf Semester Medizin an der Universität Göttingen, dann Germanistik in Berlin und Bonn. Zu Beginn seines Studiums in Göttingen wurde er 1856 Mitglied der Burschenschaft Brunsviga, in Bonn gestaltete er als Kneipgast zwei Jahre lang die Bierzeitung und wurde 1859 Ehrenmitglied der Burschenschaft Alemannia Bonn. Seit 1859 lebte er in Berlin und wurde 1862 Hilfsredakteur der Berliner Montags-Zeitung. Er war ein Bewunderer Otto von Bismarcks, ab 1866 Redakteur des politisch-satirischen Wochenblattes Kladderadatsch und von 1886 bis 1909 dessen Chefredakteur. Wegen Majestätsbeleidigung musste er 1898 eine zweimonatige Haft in der Festung Weichselmünde verbüßen. Er berichtet darüber in satirischer Form in seiner Schrift Zwei Monat Festung. Nach seinem Ausscheiden aus dem Kladderadatsch lebte er seit 1909 zurückgezogen in Warnemünde.
Johannes Trojan veröffentlichte seit 1863 31 Kinderbücher, zu denen namhafte zeitgenössische Künstler die Illustrationen lieferten (Wilhelm Claudius, Rudolf Geißler, Paul Friedrich Meyerheim und Carl Reinhardt). Seine Erzählungen für Jugendliche erschienen in Julius Lohmeyers Deutsche Jugend und in Franz Hoffmanns Neuer deutscher Jugendfreund. Erzählungen, Plaudereien, Reiseberichte sowie Beiträge zur deutschen Pflanzenwelt erschienen in Zeitungen und Zeitschriften. Für die National-Zeitung schrieb er seit 1879 zahlreiche Beiträge, von denen nur wenige in seine späteren Bücher übernommen wurden. Beiträge, die er zum Kladderadatsch geliefert hat, darunter politische Lyrik, Prosabeiträge und Scherzgedichte, konnten bisher nicht als Trojan-Produkte erkannt werden, weil in der Zeitschrift bis 1910 grundsätzlich keine Autornamen genannt wurden. In einer 2019 erschienenen Bibliographie (siehe Literatur) werden etwa 50 Bände der Zeitschrift ausgewertet, die aus dem Besitz Trojans stammen, in denen er mehr als 6000 eigene Beiträge markiert hat.
Sein Schwager war der Silhouettenkünstler Paul Konewka, aus dessen Nachlass Trojan viele Scherenschnitte veröffentlicht hat. Zu seinem Freundeskreis gehörten Wilhelm Polstorff sowie Heinrich Seidel und Julius Stinde, mit denen er im Allgemeinen Deutschen Reimverein unter dem Dichternamen „Theodor Janzen“ wirkte.
Johannes Trojan starb im Alter von 78 Jahren und wurde auf dem Neuen Friedhof in Rostock beigesetzt.